Hallo!
Wurde bei der Parasitenuntersuchung auch auf Giardien getestet???? Dazu sollte man allerdings über 3 Tage Kot sammeln, da diese nicht in jedem Häufchen unbedingt nachweisbar sind (also wohl nicht immer ausgeschieden werden).
Ansonsten solltest du vielleicht nochmal ein bakteriologisches Kotprofil machen lassen. Das was du beschreibst kommt mir arg bekannt vor von meinem Rüden. Der hatte sich hämolysierende E.coli Bakterien eingefangen und auch immer wieder Durchfall gehabt. Das wurde auch eine lange Zeit nicht erkannt, so dass das dann bei meiner Hündin auch anfing (die hatte sonst nie Probleme mit weichem Kot oder Durchfall).
Ab da sprach für mich alles sehr dafür, dass es irgendwas ansteckendes sein muss und keine individuelle Krankheit. Das würde mich bei dir auch sehr wundern, wenn alle drei an ein und der selben Sache erkrankt sein sollten. Auch ne plötzliche Unverträglichkeit wäre ja schon arg ungewöhnlich, dass das gleich alle drei betrifft.
Von daher würde ich wirklich erstmal was infektiöses abklären lassen, zumal das ja anscheinend mit dem Einzug deines dritten Hundes angefangen hat.
Liebe Grüße