Wenn dein Hund nur dann so komisch reagiert, wenn eines der älteren Kinder (der Mittlere, oder?) zu euch kommt, weil er nur sehr selten zu euch kommt, ist sein Verhalten ja eigentlich total logisch. Reagiert er bei den anderen Beiden nicht so, weil die quasi immer da sind, ist das ebenso logisch.
Er findet es normal, dass immer wieder die Jüngeren zu euch ins Zimmer gehen.
Er findet es NICHT normal, dass ab und zu mal ganz selten noch ein Anderer dazu kommt. Ist verständlich, dass er dann etwas verunsichert ist oder das als "Gefahr" ansieht bzw. es auf alle Fälle komisch findet und dies eben mit dem "anmachen" zum Ausdruck bringt.
Ihn deswegen in eine Box sperren...? Na, ich weiß nicht... Wenn, dann würde ich ein Gitter zur Begrenzung aufstellen.
Aber ich würde es eigentlich erstmal anders versuchen, nämlich dem Hund verdeutlichen, dass es auch normal ist, wenn der Mittlere nachts zu euch kommt. Muckt er rum, zeigt ihm, dass du weißt, was er meint, aber es nicht schlimm findest. Vielleicht kann man sich so das Wegsperren sparen...